引起膀胱纖維化的原因是：由於炎症導致器官實質細胞發生壞死，組織內細胞外基質異常增多和過度沉積的病理過程。
1、血管、淋巴管阻塞，曾設想膀胱纖維化是由於盆腔手術或感染引起膀胱壁內淋巴管阻塞和引起栓塞性脈管炎或由於血管炎所致永續性小動脈痙攣所致，但缺乏足夠的證據。
2、感染，曾提出過細菌、病毒或真菌感染可能是膀胱黏膜下纖維化（IC）的病因，但還沒有在膀胱黏膜下纖維化（IC）患者中檢出上述3種病原體的報道。
3、神經體液因素，肥大細胞在膀胱黏膜下纖維化（IC）病人膀胱固有膜和逼尿肌中增多，寒冷、神經肽、藥物、創傷、毒素等可活化肥大細胞，釋放血管活性物質可致敏感覺神經元，後者進一步通過釋放神經遞質或神經肽活化肥大細胞；肥大細胞也可直接引起血管擴張或膀胱黏膜損害引起炎症。
4、免疫因素，該病對皮質醇治療反應良好，部分病人血中可檢測到抗膀胱黏膜抗體，不少學者還發現對血管抗原產生的自身免疫性抗體或免疫複合物沉積在血管壁啟用補體系統參與了膀胱黏膜下纖維化（IC）發病。
5、黏膜通透性，推測膀胱黏膜下纖維化（IC）是由膀胱上皮的功能不良引起，其通透性增加並使尿液通過移行上皮漏入到膀胱壁，引起膀胱炎症。有人證實膀胱黏膜下纖維化（IC）病人膀胱表層上皮內TH蛋白增多，提示黏膜的通透性增加。
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