腦電圖(EEG)作為一種無創性檢查方法，易被家人及患兒所接受，對病毒性腦炎的診斷具有一定價值。病毒性腦炎時腦電圖異常率可達90 ％以上，主要表現為瀰漫性異常慢活動背景，多數患兒的腦電圖改變與臨床病情的嚴重程度相平行，並隨病情好轉而逐漸恢復，病情重者腦電圖恢復慢。
但需要注意：
1、病毒性腦炎腦電圖的改變是非特異的，絕不能過分強調腦電圖的診斷價值。腦電圖正常，不能排除病毒性腦炎；腦電圖異常，也不能肯定病毒性腦炎的診斷。有些地區部分兒科醫生僅僅依據患兒出現頭痛或其他非特異性症候，加上腦電圖出現“輕度異常”，即做出“病毒性腦炎”的診斷是不正確的。
2、病毒性腦炎腦電圖異常的程度與實際病變嚴重性不一定完全一致；病毒性腦炎的異常腦電圖恢復較臨床恢復為慢，常為數週或數月之久；個別病毒性腦炎恢復期隨訪腦電圖出現癇樣放電，如果未出現臨床發作，不能單憑腦電圖診斷癲癇，甚至加用抗癲癇藥物。
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