在選擇治療方法的同時。不能忽略由此帶來的負面影響。傳統的手術治療有全部或部分切除子宮的方式，但這種手術改變了內生殖器的完整性，會給患者及其配偶在心理上造成較大的創傷，從一定程度上影響了夫妻生活質量。
一是手術有可能有風險，二是子宮肌瘤剔除術後，往往會發生比較嚴重的粘連，肌瘤與膀胱、腸管以及盆壁發生粘連，這樣的粘連也許會產生腹痛的症狀，也許沒有症狀，但是對二次手術影響較大，粘連有可能會導致手術的副損傷，因為粘連，二次手術往往不能通過腹腔鏡手術來進行處理。
藥物治療主要是減少體內雌激素的產生或對抗雌激素的作用，療程長、見效慢、療效差、費用高，藥物治療對分泌系統、心血管系統、骨質代謝及第二性徵等方面有不同程度的副作用。外科學治療疾病通常採用“開刀”這種特色性手段，難免給患者帶來人為損害性創傷。
動脈栓塞的治療原理是通過一個動脈導管插到患者的子宮供血的動脈上去，然後通過一些栓塞劑把供血的動脈堵住，肌瘤在缺少血液營養供應後得到萎縮。
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