腎結核發病過程較慢。原發灶幾乎全在肺，其次是關節和腸道，多發於20-40歲青壯年，幼兒及老年少見。男多於女。約90%為單側病變。
典型的臨床表現有以下幾方面：
（一）尿頻、尿急、尿痛：最初症狀為尿頻，往往是就診時的主訴。由於結核菌尿的刺激及結核性膀胱炎，排尿次數逐漸增多，從每日3-5次逐漸增至10-20餘次，並伴尿急、尿痛，晚期當膀胱嚴重攣縮，每日排尿可達數十次。
（二）血尿和膿尿：血尿可為肉眼或鏡下血尿，但以終末血尿為主，常在尿頻之後發生。膿尿表現為尿液呈不同程度的混濁，嚴重者呈洗米水狀，也可為膿血尿。
（三）腎區疼痛和腫塊：一般無明顯腰痛，當破壞嚴重的巨大膿腎、繼發感染或病變蔓延至腎周時可出現疼痛或腎區觸及腫塊。
（四）約90%的男性患者伴有男生殖繫結核。
（五）全身症狀：當腎結核破壞嚴重、積膿或合併其它器官活動性結核病灶時，可出現消瘦、乏力、低熱、盜汗等全身症狀。雙腎結核或單側腎結核對側嚴重腎積水時，可出現慢性腎功能不全症狀，如浮腫、貧血、噁心、嘔吐、少尿或無尿等。
診斷腎結核需要性以下檢查：
（一）尿常規化驗：有多數白細胞、紅細胞和少量蛋白。
（二）尿細菌學檢查：晨尿沉渣塗片找結核桿菌，連查三次，必要時重複檢查；陽性率為50%-70%。尿結核桿菌培養，陽性率可達80%-90%。
（三）聚合酶鏈反應（PCR）及酶聯免疫吸附試驗等可提高結核的診斷率。
（四）放射學檢查：腹平片可見鈣化，結石及腎臟形態。靜脈尿路造影，可見典型的腎盞、腎盂蟲蝕樣破壞，或棉桃樣空洞陰影，嚴重者患腎不顯影。逆行腎盂造影，可顯示腎臟破壞情況。
（五）膀胱鏡檢查：可見膀胱三角區及患側輸尿管周圍充血水腫及淺黃色結核結節或潰瘍與肉芽腫。膀胱攣縮或急性期炎症時不應作此項檢查。
（六）B超和CT檢查：B超可顯示腎結構紊亂、膿腔和對側腎積水；CT對晚期病變的診斷優於靜脈尿路造影，可顯示腎皮質空洞、鈣化及管壁增厚的輸尿管等。
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