婦科囊腫多種多樣，常見的如發生在宮頸的納氏囊腫、子宮肌瘤囊性變；發生在卵巢的功能性囊腫、子宮內膜異位囊腫、多囊卵巢綜合徵等。上述囊腫一般不會影響妊娠，如囊腫體積大，可導致不孕、流產、早產風險增大。
宮頸納氏囊腫，主要是宮頸轉化區內鱗狀上皮取代柱狀上皮過程中，將腺管口阻塞導致腺體分泌物引流受阻形成。絕大多數情況下是宮頸的生理性變化，不需特殊治療，如囊腫增大，堵住宮頸口，精子不能進入宮腔，導致不孕。
子宮肌瘤囊性變，是肌細胞壞死液化發生囊性變。這類囊腫早期一般無明顯臨床症狀和體徵，多在婦科超聲檢查時被發現。如囊腫增大，壓迫宮腔使宮腔變形，宮內面積減小，使流產、早產風險增大。
功能性卵巢囊腫，多數都無明顯症狀和體徵，通常對人體是無害的，不會影響妊娠，一般無需治療即可自行消失。如囊腫較大（≥8cm），可壓迫刺激子宮，誘發宮縮，出現早產風險；如囊腫發生扭轉、破裂，出現突發劇烈腹痛、內出血，容易誘發宮縮出現流產、早產，或母體休克導致胎死宮內，應立即送醫行緊急手術治療。
子宮內膜異位囊腫，習稱巧囊，因囊腫破裂後，其內暗紅色陳舊經血流出狀如熱巧克力，故而得名。這類囊腫對人體有害，患者常有經期疼痛，不孕，不孕率高達40%。大的巧囊，在妊娠過程中存在扭轉、破裂的風險，應儘量在妊娠前治療，如腹腔鏡下巧囊切除術。
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