腦幹出血的後遺症，會有深度昏迷、植物狀態、肢體功能受限、感覺受限、語言障礙、電解質紊亂、酸中毒、腦水腫等。
腦幹出血的病死率還是非常高的，70歲以上的老年患者病死率可達70%以上，年齡越小一些，病死率相對會下降。腦幹出血的病情發展迅速，並且顱內壓增高症狀的出現的時間比較早，對於沒有死亡的患者的後遺症是比較嚴重的。如果患者出現肢體功能障礙的話，要進行系統康復訓練。語言、吞嚥功能下降，需要進行相應針對性康復訓練，有的患者可伴有認知功能的下降也需要進行認知功能的訓練。要注意腦幹出血昏迷時間長了，可能會導致患者的肢體、關節、肌肉韌帶等出現了僵化、萎縮、鬆弛的現象，都屬於康復訓練的範疇。對於深度昏迷的患者必須維持生命體徵、防止肺部感染和泌尿系感染，為避免褥瘡的發生要定時給患者翻身。
腦幹出血的後遺症，大多數情況下是比較嚴重的，所以一方面是等待血腫的吸收，另一方面要進行患者後遺症的針對性治療，如康復訓練，還要積極治療原發病。
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