腎結石可以無症狀，腰痛和血尿是常見症狀。後期還可能發生腎積水。如果腎結石導致梗阻和感染，結石阻礙尿液的排出，容易引起細菌感染，引起發熱症狀。嚴重時可導致敗血症，危及生命。
1、腰痛：如果腎結石侷限在腎盂，主要表現在腰部的疼痛、酸脹不適等。如果結石滑落到輸尿管，導致嵌頓，將引起嚴重的絞痛。腎絞痛常突然發生，一側腰背部刀割樣疼痛。可放射到下腹部、外陰部和大腿內側。持續時間不等。疼痛之後，多出現血尿，有些患者可以發現排石。
2、血尿：在腎絞痛後多出現血尿，其中只有一部分能夠肉眼發現尿是紅色的，大部分為鏡下血尿。
3、無症狀：少數腎盂中的結石較大，不活動，又無明顯梗阻感染，可長期無症狀。不少患者在體檢時偶然發現腎結石，平時沒有任何症狀。
4、腎積水：結石慢慢長大以後堵塞了腎盂和輸尿管，造成腎積水。長期腎積水，會造成患側腎功能受損。雙側腎積水嚴重者可能導致尿毒症。
腎結石有無症狀與結石大小有關。部分甚至到患側腎臟完全失去功能，症狀仍不明顯，平時體檢可通過B超和X線進行檢查。
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