沙眼衣原體作為一種病原微生物廣泛存在於人們的生活環境中。感染的途徑主要是通過直接接觸的方式，衣原體進入眼睛內或者是泌尿生殖系統等而導致患病。嬰兒感染的方式是通過分娩時經過母親的產道感染的，稱為母嬰傳播。
沙眼衣原體可能會導致多種部位感染疾病，常見的主要有眼部、泌尿系統和生殖系統，分別出現的是沙眼、尿道炎和陰道炎。在環境衛生條件差或者相對來說比較炎熱、乾燥的場所病原體容易大量繁殖，而導致傳播；抵抗力相對低下的人群容易被傳染。
眼部感染即可導致沙眼。一般情況下，一旦經過傳染之後，會出現兩隻眼睛都發病的表現。早期的時候症狀可能不太明顯，之後一旦出現了症狀，就有可能會導致相關的沙眼的併發症，疾病的週期相對來說比較久，到了出現明顯的瘢痕期就已經比較難治療了。由於結膜出現明顯的瘢痕化會出現多種併發症，比如瞼內翻、倒睫、瞼球黏連、重度眼乾燥症等，甚至出現更嚴重的角膜病變，最終失明。
預防沙眼衣原體感染主要從改善環境衛生入手，改掉用手肉眼的不良習慣，懷孕前應做好體檢，如果有問題，早期進行相關的治療是非常關鍵的。
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