若藥流不全且殘留物大於2cm，且位置接近宮腔上端時，需儘快行清宮手術，越早越好。
藥物流產不全後並非必須清宮，是否清宮以及清宮的具體時間，需根據殘留物的多少及臨床症狀而定。女性因非意願或意外懷孕後，通過藥物終止妊娠的辦法，稱為藥物流產。藥物流產後由於藥流孕囊排出後，子宮蛻膜組織混合血液可能凝結成塊，然後殘留在宮腔內不易排出，稱為藥流不全。若能藥物殘留的血塊小於1.5cm，且位置又靠近宮腔下段，可無需清宮，考慮口服益母草或生化顆粒排出殘留物，亦可打縮宮素針促進子宮收縮排除殘留物。若殘留物大於2cm，同時位置又靠近宮腔的上段，建議儘快行清宮術。
患者清宮後可適當的休息1周後，待陰道出血停止，腹痛消失，才可進行正常的工作和生活，身體素質較弱者，前三天應儘量臥床休息、適當活動。
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