現有的抗病毒藥無法徹底清除乙肝病毒，人體依靠自身的免疫去清除病毒才是主要的力量，而抗病毒藥則主要起協助和促進作用，所以要想抗病毒治療取得滿意的效果就必須學會抓住最佳時機使用抗病毒藥。乙肝病毒感染可分四期:免疫耐受期，免疫清除期，非活動性HBsAg攜帶狀態和肝炎再活動期。免疫耐受期即人體免疫系統與乙肝病毒和平共處，不把其看成異己，不對其發動進攻，此時使用抗病毒藥往往白費金錢和精力，取不到好效果；哪應該如何做呢?對於乙肝病毒攜帶者需要定期監測肝功能，當轉氨酶（即ALT和AST）逐漸升高，是人體免疫系統開始對乙肝病毒宣戰，進入免疫清除期的訊號。一般主張在沒用使用保肝降酶藥的情況下，谷丙轉氨酶（ALT）升高至2倍正常值至10倍正常值之間，是使用干擾素抗病毒治療的最佳時機。
我們抗病治療的目標是：e抗原從陽性轉陰性,e體從陰性轉陽性即大三陽轉小三陽，HBV-DNA儘可能下降至最低水平，ALT和AST恢復正常，進入非活動性HBsAg攜帶狀態。而對非活動性HBsAg攜帶狀態者，應在醫生的長期監護下，每半年複查肝功能，HBV-DNA定量，甲胎蛋白（AFP），B超查肝臟和脾臟情況，以判斷病情是否進展。
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