①肺大皰、自發性氣胸：自發性氣胸多由肺大泡破裂引起。其為胸腔鏡手術開展最普遍的病種之一。
普遍認為如下情況應考慮胸腔鏡手術治療：
a 反覆發作的單側自發性氣胸。
b 經胸腔閉式引流後持續漏氣者(7天以上)(美國胸科醫師學會(ACCP)指南建議超過3天，英國胸科學會(BTS)建議超過4天手術干預。
c 雙側自發性氣胸，不論是否同時發生。
d 巨大的肺大泡，壓迫肺組織，影響患者呼吸功能者。
②肺臟疾病、肺內孤立性病灶
胸腔鏡手術已經成為瀰漫性實質性肺疾病的最為安全可靠的診斷方法。 小於5cm的肺周圍型病變的治療：如較早期肺癌、腺瘤、錯構瘤、炎性假瘤、結核瘤、肺微小結節等。胸腔鏡可以先行肺腫瘤切除，送快速冰凍病理檢查。如為惡性腫瘤，即術中胸腔鏡下行標準的根治性手術，國際公認與普通開胸手術效果相同。
③縱隔腫瘤：非浸潤性生長的縱膈佔位病變，如胸腺瘤、畸胎瘤、心包囊腫、神經元性腫瘤、支氣管源性囊腫、脂肪瘤等，胸腔鏡手術可以較容易地切取腫瘤組織。尤其在懷疑縱隔淋巴瘤的患者，可獲得詳細的細胞學診斷，指導治療至關重要。
④心包疾病：
以往多次穿刺失敗的患者，胸腔鏡是獲得積液標本的可靠方法。提供活檢及心包開窗引流。
⑤胸外傷：進行性血胸、氣管支氣管斷裂及食管裂傷等，可以明確診斷及止血等處理。
⑥腫瘤分期：可以代替縱隔鏡更好地全面地反映縱隔淋巴轉移範圍。例如隆突下淋巴結，主肺動脈窗淋巴結及主動脈旁淋巴結等，縱隔鏡常難以發現的淋巴結。胸腔鏡手術是縱隔淋巴結活檢的極好途徑。另外，通過胸腔鏡還可以觀察肺癌或食管癌向鄰近縱隔器官或胸壁擴散的情況。判斷腫瘤切除的可能性，避免不必要的開胸探查。
⑦胸膜疾病：
A 胸腔積液：不明原因的胸腔積液，可以切除部分或全部胸膜病變送病理檢查。肺癌合併惡性胸腔積液使用胸腔鏡活檢並術中滑石粉噴塗胸膜固定術，永久消除積液，已成為國際規範化治療。
B 胸膜佔位性病變：胸腔鏡手術在直接觀察病變的同時切取足夠的組織標本，可獲得準確的病理學診斷。
⑧食管疾病：食管平滑肌瘤、賁門失弛緩症、較早期食管癌，可以經胸腔鏡手術。
⑨胸部其他疾病：胸交感神經切斷術(手汗症)、如胸導管結紮術、膈疝修補術、椎旁膿腫切開引流術等，胸腔鏡可以提供必要的顯露，完成基本的手術操作。
⑩漏斗胸：使用NUSS手術，不用開胸。
目前我院已經開展了全胸腔鏡下肺癌切除+淋巴結清掃;肺結節肺楔形切除術;自發性氣胸肺大皰切除術;縱隔腫瘤切除術;雙側氣胸修補術。
目前，我院胸腔鏡手術器械齊全，人員配備充足，已經逐步成為常規手術專案。
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