目前臨床治療尖銳溼疣方法很多，多采用區域性療法與全身療法相結合。主要是以外治為主，內治為輔。
1、藥物治療。包括免疫製劑，抗病毒製劑，中藥製劑等多種藥物。
2、冷凍治療。液氮或二氧化碳乾冰冷凍，使疣組織（即面板損害區域性）壞死。冷凍治療的最大好處是區域性去除疣體快，治癒率約70％左右，但複發率較高。治療過程中會有區域性紅腫，疼痛及水皰潰瘍反應。目前很少採用。
3、鐳射治療。對錶淺的溼疣合適；它的特點是見效快，在治療的當時，疣體即可脫。常用的是二氧化碳鐳射，燒灼疣體，一般1次即可使疣體脫落。但是，由於鐳射的光束過於集中的原故，鐳射治療只適用於疣體不太大的尖銳溼疣，如疣體較大，則不適合。鐳射治療見效快，但複發率也高。
4、電燒治療。電燒灼是較老的一種治療方法。過去醫師常用高頻電刀燒灼尖銳溼疣和其他面板贅生物。它的特點是操作簡單，見效快，但損傷大，燒灼創面恢復慢，遺留疤痕，複發率較高。
5、手術治療。對帶蒂的較大、孤立的疣體可考慮手術切除。尖銳溼疣一般不主張手術切除，因為手術治療後，尖銳溼疣很容易復發，使治療失敗。但對帶蒂的、較大的疣體或疑有惡變者，可考慮手術切除。有的患者尖銳溼疣生長過於迅速，或大如菜花，其他治療十分困難，可考慮手術治療。為防止復發，術後應該配合其他治療。
6、光動力療法
療效確切，清除率高，複發率低，安全無創，不需麻醉，無痛苦，不留疤痕。最大的優勢是可以清除HPV亞臨床感染和潛伏感染病灶，顯著降低複發率。尤其適用於尿道內，宮頸內，肛門周圍等特殊解剖部位的治療，特別適合治療反覆復發的尖銳溼疣以及用其他療法治療無效的患者。或者配合其他治療方法進行綜合治療。是目前尖銳溼疣的理想治療方案。
7、食療可用於尖銳溼疣輔助治療
在中醫書籍中，確實有很多的食療方有助於尖銳溼疣的康復。它們的共同特點是具有清熱解毒、除溼消疣的作用。下面介紹幾首食療方以供讀者參考。
(1)蛇舌草飲(《中藥大辭典》)
組成 白花蛇舌草30～60g
用法 水煎取汁，去渣，調入蜂蜜適量，頻飲。
適應證 尖銳溼疣中醫辨證屬毒熱者。
(2)菝葜飲(《中藥大辭典》)
組成 菝葜根500g 甘草25g
用法 水煎2次，濾液合併，再以文火濃縮至100mL，每服50mL，每日2次。
適應證 尖銳溼疣中醫辨證屬毒熱者。
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