超聲波和CT都是肝癌的定位診斷方法，在診斷肝癌的靈敏度和特異性方面各有優缺點，選擇何種檢查應根據病情而定。由於B超和CT的檢查肝癌的敏感性相差不大，但B超的費用要顯著低於CT，肝癌的初步檢查要選擇B超，在病情需要的情況下可進一步檢查CT。
1、肝臟佔位性病變經B超難以確定其良惡性時，可做增強CT進一步確定其性質。
2、準備進行手術切除治療時可做CT瞭解肝癌有無肝內的轉移。
3、手術後的隨訪只做B超結合甲胎蛋白檢查即可，如B超發現有復發或可疑復發時可做CT檢查。
4、肝癌行肝動脈栓塞化療後應做CT檢查瞭解肝癌內碘化油的填充情況，以指導下一步的治療。
5、有時作為診斷方法，經肝動脈注射少量的碘化油後的2－3周做CT檢查，這種CT掃描叫碘化油CT，能檢測出直徑在0.5cm大小的肝癌。
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