TSH抑制治療的原理是：應用L-T4將血清TSH水平抑制到正常低限甚至低限以下，以求通過抑制TSH對甲狀腺細胞的促生長作用，達到縮小甲狀腺結節的目的。療效方面：在碘缺乏地區，TSH抑制治療可能有助於縮小結節、預防新結節出現、縮小結節性甲狀腺腫的體積；在非缺碘地區，TSH抑制治療雖也可能縮小結節，但其長期療效不確切，停藥後可能出現結節再生長；TSH部分抑制方案（TSH控制於正常範圍下限，即0.4-0.6mU/L）與TSH完全抑制方案（TSH控制於<0.1mU/L）相比，減小結節體積的效能相似。副作用方面：長期抑制TSH可導致亞臨床甲亢（TSH降低，FT3和FT4正常），引發不適症狀和一些不良反應（如心率增快、心房顫動、左心室增大、心肌收縮性增加、舒張功能受損等），造成絕經後婦女的骨密度（BMD）降低。權衡利弊，不建議常規使用TSH抑制療法治療良性甲狀腺結節；可在小結節性甲狀腺腫的年輕患者中考慮採用；如要使用，目標為TSH部分抑制。
131I主要用於治療有自主攝取功能並伴有甲亢的良性甲狀腺結節。對雖有自主攝取功能但不伴甲亢的結節，131I可作為治療選擇之一。出現壓迫症狀或位於胸骨後的甲狀腺結節，不推薦131I治療。處於妊娠期或哺乳期是131I治療的絕對禁忌證。療效方面：131I治療後2-3月，有自主功能的結節可逐漸縮小，甲狀腺體積平均減少40％；伴有甲亢者在結節縮小的同時，甲亢症狀、體徵和相關併發症可逐漸改善，甲狀腺功能指標可逐漸恢復正常。如131I治療4-6個月後甲亢仍未緩解、結節無縮小，應結合患者的臨床表現、相關實驗室檢查和甲狀腺核素顯像複查結果，考慮再次予131I治療或採取其他治療方法。131I治療後，約10％的患者於5年內發生甲減，隨時間延長甲減發生率逐漸增加。因此，建議治療後每年至少檢測一次甲狀腺功能，如監測中發現甲減，要及時給予L-T4替代治療。
其他治療良性甲狀腺結節的非手術方法包括：超聲引導下經皮無水酒精注射（percutaneousethanolinjection,PEI）、經皮鐳射消融術（percutaneouslaserablation,PLA）和射頻消融（radiofrequency
ablation,RFA）等。其中，PEI對甲狀腺良性囊腫和含有大量液體的甲狀腺結節有效，不適用於單發實質性結節或多結節性甲狀腺腫。採用這些方法治療前，必須先排除惡性結節的可能性。
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