好多人體檢時被診斷為乙型肝炎，但不一定所有感染乙肝病毒的人都需要治療。
表面抗原陽性表示曾經感染過乙肝病毒，病人應接受更進一步檢查，包括乙肝乙肝兩對半、病毒基因(DNA)、肝脾超聲、肝功能試驗。如果臨床缺乏病狀、肝脾不腫大，肝功能正常，則多數為無症狀性攜帶狀態。對於這種病人，應著眼於維持體內免疫穩定，不宜盲目經由增強免疫功能來清除病毒，因為一方面藥物過多會增加肝臟負擔，另一方面，機體免疫耐受一旦被打破，會引起免疫系統攻擊感染的肝臟細胞，繼而引發肝病變。干擾素製劑對此病人多數無效。如果需要可使用核苷類藥物，這一類藥可直接抗病毒，與免疫系統沒多大關係。
對於轉氨酶反覆升高，症狀多且重，表面抗原、e抗原、核心抗體均陽性即所謂乙肝大三陽慢性乙肝患者，一定得進行抗病毒、保肝和抗纖維化治療。以使病毒複製迅速得到抑制，減少肝細胞損害，減輕肝纖維化，從而阻斷肝硬化的發生。即使病人不是“大三陽”但只要肝功能長期不正常，或已有肝硬化的早期病狀，仍需抗病毒治療。可應用對病毒有直接抑制作用的藥物，也可應用免疫調節藥物，通過強化機體免疫功能而抑制病毒。干擾素製劑是法定藥物，中藥中苦蔘、豬苓多糖、苦味葉下珠等均具有著的療效，依據病毒感染量、肝臟功能狀態、免疫狀態而設計的免疫程式醫治，花費不多，遠期功效往往較好。
對於表面抗原陽性、e抗體、核心抗體陽性的所謂乙肝小三陽患者，應區別狀況具體對待。如果經由一次肝炎發作或經正規抗病毒治療，由乙肝大三陽轉為乙肝小三陽，常表示疾病康復;但如果血清中病毒基因仍高，肝功能不正常，常表示病毒變異。在我國慢性肝病患者中70％左右有這種變異現象。由於這種變異病毒逃避免疫監視，常易發展為慢性重症肝炎，與肝硬化、肝癌的關係更為密切。對於這種病人的治療類似於前述的乙肝大三陽慢性乙肝，但診治往往更困難，常需幾種藥物聯合醫治;對於家族中有肝癌史、年齡35歲以上男性乙肝小三陽患者，有主張定期進行抗病毒或免疫調節治療，防止肝癌發生。
對於肝硬化的患者，應抑制病毒、抗纖維化等治療.以減輕肝損害，阻止向失代償發展。核苷酸類長期使用具有遏制作用。
對於肝功能正常，沒有自覺症狀，亦沒有肝組織學變化的HBV感染者，不需要治療，應該定期複查肝功能和肝形態學，必要時肝組織學檢查。
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