甲狀腺癌的病理型別較多，臨床生物學特性差異很大，低度惡性的甲狀腺癌有時可自然生存10年以上，有的甚至有肺轉移時還能帶瘤生存5年以上。但高度惡性的甲狀腺癌可以短期內死亡。絕大多數甲狀腺癌的發生起源於濾泡上皮，少數可以來自濾泡旁C細胞，極少數來自甲狀腺的間質。甲狀腺除了有原發癌以外，還可以有繼發轉移性腫瘤。
目前國內外多采用以下分類：
1、乳頭狀癌(隱癌、腺內型、腺外型)；
2、濾泡樣癌(包膜血管輕微或可疑浸潤，包膜中度或明顯浸潤)，包括Hürthle細胞癌；
3、髓樣癌(家族遺傳型、散發型)MEN-2A或MEN-2B；
4、未分化癌(包括鱗狀細胞癌)；
5、惡性淋巴瘤；
6、轉移癌；
7、其它。
(注：乳頭狀癌和濾泡狀癌又稱為分化性甲狀腺癌)
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