甲亢治療方法主要有三種，包括內科抗甲狀腺藥物治療（如：甲巰咪唑、丙基硫氧嘧啶等）、131碘治療、外科手術治療。
1、內科抗甲狀腺藥物治療
其治療比較溫和，在治療過程中可及隨時調節藥物劑量。但是治療時間長，一般需規範治療2-3年，治療期間要定期檢查甲功、血常規、肝功等，因抗甲狀腺藥物可以引起肝功及造血系統的損害；另外，該藥物可以引起過敏反應，治療中減量或停藥很容易引起甲亢復發，有報道其複發率在40％-60％。
2、手術治療
能很快緩解甲亢症狀，特別適用於甲狀腺明顯腫大並伴有結節的患者。但手術損傷較大，個別病人造成喉返神經受損、甲狀旁腺損傷等，也有部分患者甲亢復發或出現甲減等。
3、131碘治療
其治療方法簡便，也能較快的緩解甲亢症狀，一般治療後3-4周症狀開始改善，不會出現過敏反應、一般不會造成肝功及造血系統損害。主要的缺點是有少數患者出現甲減，不過甲減只要簡單的每天服用甲狀腺激素替代治療即可。對於那些因為抗甲狀腺藥物治療引起的肝功異常或白細胞降低、過敏的患者，以及抗甲狀腺藥物治療效果不佳的患者，均可以選擇131碘治療。
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