手足口病潛伏期3～5天，有低熱、全身不適、腹痛等前驅症。1～2天內口腔、咽、軟顎、頰黏膜、舌、齒齦出現疼痛性粟粒至綠豆大小水皰，周圍繞以紅暈，破潰成小潰瘍，由於疼痛，常流涎和拒食。手足口病主要發生在4歲以下的兒童，但成人也有可能得病，因此可以說每個人都是易感的。感染後只獲得該型別病毒的免疫力，對其它型別病毒再感染無交叉免疫，即患手足口病後還可能因感染其它型別病毒而再次患手足口病。那麼，舌齒齦疼痛性粟粒至水皰如何鑑別診斷呢？需與皰疹性咽峽炎、單純皰疹等相鑑別。
手足口病發生時，病兒常以發熱起病，其熱度不等，也有不發熱者，但以低熱者居多約點半數。且常伴有流涎、流涕、口痛、咽痛及厭食等症狀。臨床以口腔、手足皰疹為主要特徵。口腔皰疹見於舌、頰粘膜、硬顎、口脣、咽及扁桃體，約3mm大小，並迅速破潰形成潰瘍。皮疹多見於手足遠端、手指指間，足跟邊緣和甲周，手掌和足跖亦多見，下肢及臀部可呈密集分佈的丘疹樣皮疹，初起為斑丘疹，後轉變為皰疹，圓形或橢圓形，約3~7mm如米粒大小，較水痘皮疹為小，質地較硬，周圍有紅暈。皰疹數目少的僅幾個，多的幾十個。一般病程較輕而短，多於1周左右痊癒，皮疹消退後不留瘢痕或色素沉著，如有繼發感染常使面板損害加重。
手足口病一年四季均可見到，以夏秋季較多。發病初期先有發熱、咳嗽、流涕和流口水等像上呼吸道感染一樣，有的孩子可能有噁心、嘔吐等症狀。以後手、足的指及趾背部出現橢圓形或梭形的水泡，皰的周圍有紅暈，水皰的液體清亮，水皰的長軸與皮紋是一致的。然後水皰的中心凹陷、變黃、乾燥、脫掉（脫屑）。另外指、趾端有散在的比較堅硬的淡紅色丘疹或者皰疹。同時，在口腔裡，如嘴脣、舌、口腔粘膜、齒齦上也有散在的水皰，但口腔裡的水皰很快破潰而形成灰白色的小點或灰白色的一層膜，其周圍有紅暈，在灰白色的膜下可以見到點狀或片狀的糜爛面。手足口病是由病毒感染引起的，感染源為皰疹液、咽喉分泌物、糞便汙染的手、玩具、食具等。它的潛伏期是3-8日。
根據流行病學特點，口腔、手、足出現皰疹，咽拭子、血液及皰液中分離培養出COXA19病毒可確診。
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