2004年WHO將腎癌的病理型別分成了腎透明細胞癌、腎乳頭狀腺癌、腎嫌色細胞癌、集合管癌和髓樣癌、多方囊性腎細胞癌、Xp11易位性腎癌、神經母細胞瘤伴發的癌、黏液性管狀及梭形細胞癌和未分類腎細胞癌10個亞型，其中最常見的型別為透明細胞癌，約佔腎癌的60％～85％；其次是腎乳頭狀腺癌，約佔7％～14％，預後相對較好；第三類常見的病理型別為嫌色細胞癌，約佔4％～10％；其他的均為少見型別，其中集合管癌和髓樣癌預後較差。
同一種類型腎癌細胞的惡性程度存在差別，醫學上根據癌細胞核的大小及形態等差別對腎癌細胞的惡性程度進行分級，最初腎癌分級是1982年FuhrmanⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四級分類系統，1997年WHO對其進行了調整：Fuhrman分級中的Ⅰ、Ⅱ級合併為一級即高分化，Ⅲ級為中分化，Ⅳ級為低分化或未分化，低分級或高分化提示癌細胞惡性程度低，而高分級或低分化提示癌細胞惡性程度高，目前國內醫院主要採用以上兩種分級標準。
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