蒲地藍消炎口服溶液的說明書中不良反應為尚未明確，查閱文獻發現蒲地藍消炎口服溶液治療急性化膿性扁桃體炎的研究中患者出現的不良反應多表現為腹瀉、嘔吐和體溫波動。蒲地藍消炎口服溶液治療菌斑性牙齦炎過程中，有兩例患者出現味覺異常反應，停藥後恢復正常。2018年國家藥品監督管理局對蒲地藍消炎片（膠囊）的不良反應進行修訂，由於口服溶液與片劑和膠囊劑的成份相同，所以蒲地藍口服溶液的不良反應主要包括消化系統、面板系統以及神經系統。消化系統的不良反應有噁心、嘔吐、腹脹、腹痛、腹瀉、食慾減退等症狀，面板系統的不良反應為皮疹、瘙癢等過敏反應，神經系統的不良反應包括乏力、頭暈、感覺異常等症狀。此外，由於蒲地藍消炎口服溶液成份中的四味藥材均性寒，孕婦需要慎用；腹痛、喜暖、洩瀉等脾胃虛寒的患者服用後可出現面色蒼白、出虛汗等症狀導致病情加重，需要慎用；月經期間的女性也需要慎用，避免用藥後出現月經量減少、痛經等症狀。
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