嘴脣潰瘍的治療首先要根據病因，嘴脣潰瘍病因多為區域性外傷、精神緊張、飲食、某些藥物、營養差、低蛋白、激素水平異常以及必要維生素或微量元素缺乏。其中區域性外傷、飲食及維生素微量元素缺乏較為常見。
因為嘴脣為黏膜組織，周圍神經密佈，所以潰瘍後痛感較為明顯，且週期較長。如果是外傷導致的傷口潰瘍發炎，應及時採取治療，輕微的可口服藥物治療即可，如較為嚴重則建議採取手術治療；如因為飲食過於堅硬幹燥使嘴脣出現潰瘍性改變，一般外用西瓜霜噴劑即可解決，還應注意飲食清淡避免反覆；如果因為缺乏維生素及微量元素出現潰瘍，這類潰瘍常稱之為上火，在外用藥物的基礎上還要多吃新鮮的蔬水果，必要時需要補充維生素及微量元素。
嘴脣潰瘍一般是自限性疾病，多數可不治而愈，如果反覆發作應及時就診口腔科，治療上應藥物結合飲食和作息的調整，方可事半功倍。
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