長期大便不成形常提示身體存在異常現象，常見原因包括腸癌、腸結核、炎症性腸病等器質性病變，也包括腸道菌群失調、腸道功能紊亂等功能性病變。
如果長期大便不成形，一般建議患者至消化內科就診。如病因為腸癌，則需以手術治療為主，並配合化療及放療等綜合治療。若為腸結核，患者可能伴有黏液膿血便等，應早期、足量、足療程的進行抗結核治療，必要時給予糖皮質激素治療。若為腸炎所致，其治療主要以抗炎、免疫抑制劑等藥物治療為主。
此外，建議患者平時養成良好的生活習慣，放鬆心情、緩解壓力，減少酒精、尼古丁和咖啡因的攝入，以免刺激消化系統。
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