代煎中藥的儲存時間與藥物的包裝、環境溫度以及中藥的成分有關，不可一概而論。
代煎的中藥如果用密閉真空包裝袋包裝，常溫下可以保質期一週，但在室溫高於25℃時保質期通常不超過2-3天；如果放在冰箱內0-5℃下冷藏，保質期大概在30天，建議儘量在7天內服用。但若中藥沒有用密閉真空的容器盛放，一般建議當天服用；若想隔天繼續服用，建議放在冰箱的冷藏室裡，並且儲存時間不應超過3天。如果中藥成分中含有較多的澱粉、蛋白質、糖類等，更容易變質，則應儘快服用。
此外，代煎的中藥還需放在陰涼通風處，以免藥物變質，影響治療效果，患者應按療程儘快服用。待全部服用完後，可以到醫院相關科室複診，以觀療效。
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