手足口病及皰疹性咽頰炎傳染性都非常強。患兒及無症狀帶病毒者的唾液、皰疹液、糞便均含有較多的病毒，可汙染手、毛巾、水杯、玩具、餐具等，通過日常接觸可經口感染。患兒咽分泌物中也含有病毒，所以咳嗽、噴嚏等也可造成傳播。
手足口及皰疹性咽頰炎患病後不像水痘、麻疹可以獲得終身免疫，如果孩子去年患過本病，今年依然可以患病。
手足口病及皰疹性咽頰炎目前都沒有疫苗。
手足口病和皰疹性咽頰炎在預防上有一定難度，常造成較大範圍的流行。但我們依然可以做一些事情：
保證室內通風
患兒咳嗽流涕排出的病毒，彌散在空氣中。空氣流通，可以降低空氣中病毒的含量，減少發病。夏天一般會開窗戶，但開空調後常常門窗緊閉。建議即使開空調，每天也要有開窗通風時間。
減少公共場合出入
超市、購物中心、餐廳、早教中心冬天暖風夏天空調，比較少開窗通風，又常常人口密集，其中不乏患者，是交叉感染高發的地區，儘量避免帶孩子出入。現在天氣溫暖，如帶孩子玩最好在戶外。室外有些地方人也比較多，但空氣流通，有日光照射(陽光中的紫外線有殺病毒作用)，比較不容易傳染疾病。
幼兒園做好晨檢
門診有些手足口病或皰疹性咽頰炎患兒就是幼兒園晨檢時發現的。晨檢發現後可實行即時隔離，減少班級孩子交叉感染的發生。每年的手足口病和皰疹性咽頰炎幼兒園都是最高發的區域，幼兒園的有效預防對疾病的控制非常重要。
晾晒衣被，消毒玩具
患兒的皰液可以汙染衣被，如家中有其他孩子，接觸這些衣被，會造成交叉感染。
可使用含氯消毒劑消毒毛巾、玩具等。
飯前便後洗手
飯前、便後、外出後要用洗手液或肥皂等給孩子洗手，看護人員接觸孩子前、替孩子更換尿布、處理孩子糞便後均要洗手。
多喝水、清淡飲食、每日正常大便
多喝水是醫生的大招，但這招真的有用。現在天氣越來越熱，督促孩子喝更多的水是家長的一個任務。飲食適當清淡，魚肉蛋可以吃，但不要一餐吃很多，或餐餐吃很多。尤其週末，不要帶孩子到他們最愛的餐廳大吃。
督促孩子每天一次成形軟便也很重要。
少吃熱性水果
5月底6月初櫻桃馬上批量上市了，非常好吃的水果，孩子吃起來方便，但不要讓孩子吃的特別多，易引起內熱、便祕，身體狀況不佳而易患病。類似的水果還有芒果、榴蓮。以及不是水果的堅果、巧克力。
患兒要痊癒後再上學
患兒要待體溫正常、皰疹結痂脫落，症狀完全消失後方可去戶外活動或上幼兒園或學校，以免造成疾病流行。
手足口和皰疹性咽頰炎傳染性強，上述預防措施如加以注意，還是有一定預防作用的。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。