克羅米芬和促性腺激素，能使大多數無排卵婦女誘發排卵並獲妊娠，然而，這些促排卵藥物對妊娠有無不良影響，特別對發育中的胚胎是否有致畸作用，已經引起人們的關注和顧慮。
先天畸形是指出生時可見的結構性缺陷，雖然很多在細胞與分子水平的異常，實質上亦為先天性，但一般統計不包括在內。妊娠28周以後，正常人群中先天畸形的發生率為3.1％0-22.5％0。最近一份世界性調查顯示約2000萬出生兒中，先天性畸形發生率根據出生證明為8.3％0，按醫院記錄為1.26％;按兒科醫師的檢查為4.5％;如根據嬰兒6個月及12個月時的檢查，則發生率加倍，達7.5％。由於形態正常與異常之間的界線常很模糊，因之導致發生率的很大變異。
排卵誘導劑臨床應用已有近50年，治療期間或其後已有很多人妊娠，因此，瞭解其是否增加婦女分娩先天畸形嬰兒的危險，非常重要。從多年來的研究來看，誘發排卵的藥物並沒有增加畸形的危險存在。有部分研究結果提示，誘發排卵藥物可能與先天畸形有聯絡。但據推論認為，伴有卵子老化的無排卵，在雙胎、生育力低下及克羅米芬等藥物治療時常見，畸形的發生更可能與生育力低下有關，而不是藥物本身所致。可能卵子在植入宮腔前，甚至在受精前即以受損，或因卵子、精子本身老化而導致畸形。
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