在現代社會中，在未病時，預防性用藥無疑是比治療用藥更好的一著。在未病時，就將可能發生的尿路感染截斷，除生活上的預防外，預防性用藥也是重要的環節，特別是針對本病易發、多發的特點，在以下幾種情況下要進行預防性用藥：
1、婦女月經期、妊娠期，以及過度疲勞或抵抗力降低時，進行短期預防性用藥，常能起到預防作用。值得注意的是，在16周前和30周後的孕婦應該避免使用磺胺類藥物，預防性服藥可使用呋喃妥因50mg，每晚服用，直至產後。
2、與性生活有關的反覆發作的女病人，於性生活後即刻排尿，並按常規用量口服一次抗菌藥作預防。如在性生活前服用更好。據Asscher統計，有效率達80％，Stamey認為，反覆發作的女性病人，可能與其配偶的包皮過長藏汙納垢有關，應勸告其配偶矯治。
3、在尿路感染髮作較頻的婦女，即使其發作與性生活關係不大，如能每夜服一個劑量的抗菌藥作預防，亦可大大減少尿路感染的發生。
4、在尿路器械檢查之前，宜口服一次抗菌藥作預防，特別是對於以往曾有反覆發作的尿路感染史或有尿路異常者，在尿路機械檢查前後48小時宜服用抗菌素以預防感染。在留置導尿的頭3天，給予抗菌藥可預防或延遲尿路感染的發生。
5、對於尿路感染反覆發作的人
，可在尿液培養無菌後使用預防性治療。最近有人報告，睡前服用呋喃妥因50mg是極為有效的，也可服用磺胺增效劑100mg，複方新諾明0.48克，或氟哌酸0.2克。如果系腎功能不全的病人，可口服烏洛托品1克，頭孢黴素0.125克。國外資料證明，呋喃妥因一個劑量0.05克或0.1克，效果極好。而且，該藥不會導致腸道菌群失調，不會促使細菌抗藥性發生。作為預防性用藥，磺胺增效劑的長處是它有部分通過陰道排洩，這有助於性活動期婦女尿路感染的預防。
一般人睡眠後多不排尿，尿液長期停留在膀胱內，有利於細菌的生長繁殖，故臨睡前服一個劑量的抗菌藥，能抑制細菌的生長，對尿路感染有良好的預防和治療作用。臨床觀察，隔夜服藥，或每週三次服藥，或在性交後一次一個劑量服藥，效果與每晚服藥相似。
6、對反覆尿路感染的老年婦女，應儘早考慮使用口服或區域性雌性激素治療。雌性激素可以促進陰道上皮細胞糖原堆積，使乳酸桿菌生長，併產生乳酸，使陰道分泌液酸性化，從而抑制老年性陰道內潛在的病原菌生長。
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