消化系統的發育在胎兒時期就已經很完備了，此時，胎兒已經可以通過吞吐母親的羊水來攝取一些營養物質，但還不具備正常的消化功能，出生後這種能力逐漸發育並迅速完善。新生兒和嬰兒的消化吸收能力是隨著母乳餵養兒迅速發展。研究顯示，母乳餵養的嬰兒在出生後數週已能吸收80％~90％的脂肪、蛋白和糖。但是，用牛乳餵養的嬰兒，在出生後4~5個月，對牛乳中脂肪的消化吸收仍很差。新生兒的腸管通透性強，發育到4~5歲時，才可以說接近成熟。從這個發育過程我們可以瞭解到，發生食物性變態反應的可能性在嬰幼兒時期就已經開始，在這一時期發生食物性變態反應的也屢見不鮮。特別是新生兒時期的腸道通透性強，所以在這一時期餵給嬰兒的牛奶中的蛋白質雖未充分消化也能被吸收，從而容易引起變態反應。這也可以解釋食物性變態反應為什麼在嬰兒期之前較多。
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