兒童肥胖由多種因素相互作用而發病，臨床上分為單純性肥胖症和病理性肥胖症兩大類，其中單純性肥胖症在兒童期最多見，大約佔兒童肥胖總數的95％;病理性肥胖又稱為繼發性肥胖，是繼發於其他疾病而產生的，僅佔兒童肥胖的5％。
1、遺傳
父母中有一位是肥胖者，其子女肥胖機率為40％至50％;父母皆為肥胖者，其子女肥胖機率為70％至80％。
2、飲食習慣
若家長任由孩童吃高脂及高熱量食物，而且經常要他們吃光所提供的食物，甚至以獎勵方式來鼓勵孩子吃東西，容易令孩子變得肥胖。
3、心理代償作用
當兒童心理不安、緊張或受挫折時，會找來甜食、高熱量食物，以不斷進食來填補心理不安，養成進食過量的習慣。
4、服用藥物
如抗過敏藥物、性激素、類固醇、抗抑鬱藥、抗癲癇藥等。
5、生理因素
可能源自於患者本身的新陳代謝較亢進，內分泌失調、染色體異常、大腦控制飽食飢餓中樞失控或疾病等因素。
根據小兒生長髮育的特點，小兒有兩個容易發生肥胖的時期：一是嬰兒期，另一個時期是5～10歲這一階段。在這兩個時期中，都同時存在脂肪細胞數量增加和脂肪細胞體積增大兩個過程。只是在嬰兒期以脂肪細胞數量增加為主，而在兒童期則以脂肪細胞體積增大佔優勢。脂肪細胞在這兩個時期所增加的數量，以後在人的一生中都不會減少。因此，在這兩個時期都迅速肥胖的兒童，日後若營養過剩，使脂肪細胞體積增大，都有可能呈現肥胖。
6、運動量減少
現在兒童學業繁重，活動空間少，運動量明顯不夠。每天坐在電腦和電視機前的時間過長，本身肥胖的孩子就不愛運動，這樣就形成了惡性迴圈加速了肥胖症的形成。
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