近年來，鼻咽癌由於放射治療的進步，調強放療技術的應用，治療的療效顯著提高。不僅如此，放療所造成的併發症後遺症也相應減少減輕，並且與以前常規放療年代的副反應有所差別。調強放療造成的併發症主要有以下幾個方面。
第一、口乾。因為在放療過程中，負責分泌唾液的腮腺、頜下腺臨近放療靶區，不可避免受到照射，導致這些腺體萎縮，分泌唾液明顯減少，從而發生口乾。但是，與以前相比，調強放療引起口乾的程度明顯減輕，絕大部分患者不需要夜間飲水。目前對於口乾沒有很好的治療方法，大部分患者在一到兩年後，口乾程度會明減輕。
第二、耳鳴，耳閉，聽力下降。主要有以下幾個方面原因：
1、腫瘤侵犯咽鼓管，以及放療引起咽鼓管粘連，中耳分泌物無法從咽鼓管排出，引起漿液性中耳炎，聲音傳導異常，導致聽力下降。
2、有巖尖骨質侵犯的病人，放療區域臨近內耳，放射性引起內耳損傷。
3、放療過程中，採用順鉑化療，順鉑有聽神經損傷的副作用。以上因素可以導致患者在放療結束後，出現耳鳴、耳閉、聽力下降的併發症。處理上首先是預防為主，放療時內耳的劑量儘可能控制在安全的範圍，發生漿液性中耳炎，可以進行置管引流。部分有感染的患者，還需要使用抗生素治療。
第三、鼻炎與鼻竇炎。主要表現是鼻塞，分泌物增多，頭痛等。部分鼻腔和鼻竇是放療的靶區，受到放射線照射後，鼻竇鼻腔粘膜上的纖毛遭到破壞，纖毛能夠通過擺動把分泌物排出，因此放療後分泌物無法正常排出，加上區域性的抵抗力下降，容易併發鼻炎和鼻竇炎。處理上要堅持鼻腔沖洗，可以使用桃金娘油一類的藥物促進分泌物排除，區域性用一些潤滑消炎的滴鼻劑，避免受涼，在空氣質量不佳灰塵較多的時候，戴上口罩。
第四、放射性腦損傷。對於區域性病灶較大，侵犯了海綿竇、顳葉、斜坡的患者，放療過程中顳葉、腦幹、視神經以及視交叉，不可避免的受到照射，可能在遠期併發相關區域的損傷，出現相應的臨床表現。這種情況重在預防，儘可能在保證腫瘤區域劑量的同時，儘可能減少神經腦組織的照射體積和劑量。
第五、頭頸皮下水腫。由於面頸部組織受照射後淋巴管道閉塞，，深部毛細血管水腫，導致面部、頸部組織間隙引流不通暢，從而導致水腫。一般在放療後1-3個月開始出現，3-6個月最嚴重，半年到一年左右消失，對身體沒有影響，不需要特殊處理。
第六、軟組織感染。放療後因為區域性淋巴細胞被放療清除，血管閉塞血供不好，以及淋巴管道閉塞引流不通暢，少部分患者可以出現蜂窩織炎，表現為頸部區域性區域紅腫熱痛。這個時候要積極處理，儘快適應抗生素進行抗感染治療。
以上幾種併發症，與以前二維放療時代相比，發生率和嚴重程度，都明顯降低。還有其他的一些併發症，如張口困難、頸部纖維化、齲齒等，在調強放療時代已經非常少見。
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