膽囊炎與膽石症互為因果，急性膽囊炎和慢性膽囊炎是膽囊受細菌的侵襲，膽囊壁水腫、發炎，致使囊壁的血供障礙，進一步加劇炎症，膽囊對膽汁酸和卵磷脂吸收增加，使膽汁酸正常比例失調。細菌感染可使膽汁容易變為酸性，膽固醇容易沉澱。膽囊由於炎症，囊壁粘膜脫落。膽囊、膽管的炎症，可造成膽汁淤滯，這些都是形成結石的重要因素。如果結石形成，由於結石的刺激或結石嵌頓於膽囊頸或膽囊管內，膽汁排洩不暢，膽汁對膽囊壁的化學刺激，又非常容易受細菌感染，發生急性膽囊炎，或者使慢性膽囊炎急性發作。
在膽囊炎病人中，90％以上是由結石引起的，有10％是非結石性膽囊炎，最常見的有梗阻性膽囊炎，由於膽囊管過長扭曲、粘連，淋巴結腫大，腫瘤，異位動脈壓迫等因素都可造成膽囊管梗阻，使膽囊排空障礙，膽囊受化學刺激，細菌感染造成急性膽囊炎。還有化學性膽囊炎，由於胰液反流進入膽囊，具有活性的胰酶可造成急性膽囊炎。還有些脫水病人，膽鹽濃度升高，也可發生急性膽囊炎。細菌性膽囊炎，如敗血症、結核、傷寒、放射線菌等細菌感染造成血行播散而發生細菌性膽囊炎。也可由於創傷、手術造成血容量不足，血管痙攣，血流緩慢，膽囊動脈還可形成血栓致使膽囊壁缺血壞死，繼發膽囊感染。因此膽囊炎與膽石症關係密切，必須同時防治。
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