現今的麻醉胃鏡檢查技術，可解決那部分年幼不合作患兒的內鏡檢查問題。從我院內鏡檢查的經驗來看，學齡兒童的內鏡檢查基本上同成人;學齡前兒童及幼兒絕大部分術前適當鎮靜的情況下可完成診療，個別需麻醉的情況下才能按成。
(一)小兒胃鏡內鏡診療的適應症
1、吞嚥困難或吞嚥疼痛：應排除到口咽或食管疾患。
2、原因不明的嘔吐：應除外消化系統疾患引起的嘔吐。
3、原因不明的胸痛：在除外心、肺部疾患後，胸痛多見於食管的炎症或潰瘍，其胸痛特點常伴隨進食而發生。
4、原因不明的腹痛：是兒科臨床常見的症狀，涉及到的範圍較廣，有功能性的，也有器質性的，胃鏡對確診十分有利。
5、上消化道出血：其原發病除全身性疾病外(例如血液系統疾病或嚴重的感染性疾病)，來自消化系統的出血多來自食管、胃、十二指腸的急慢炎症、消化性潰瘍、門脈高壓症引起的食管、胃底靜脈曲張破裂出血，以及血管瘤，過敏性紫癜等。
6、吸收不良和慢性炎症性腸病：臨床上常碰見一些難治性腹瀉或吸收不良的患兒，這類患兒一般表現為病史長，發育、營養狀況欠佳，用常規檢查方法很難找到病因。這類病例適合於做內鏡檢查，可觀察上消化道的黏膜狀況，同時可以從食管，胃和十二指腸，乃至空腸近端取黏膜活檢，做病理組織學檢查。
7、誤吞腐蝕劑：可以預測愈後。
8、內鏡治療：如取消化道內異物或蛔蟲;消化道出血止血;消化道息肉摘除等。
(二)上消化道內鏡檢查的禁忌症和併發症
1、禁忌症：急性咽炎，重症心臟或呼吸系統疾病，消化道穿孔的急性期，以及全身狀況難以承受內鏡檢查者。
2、併發症：經過近20年的臨床實踐證明，內鏡檢查總的來說是一種安全有效的方法。
(三)下消化道內鏡(腸鏡檢查)的應用
1、適應症
1、原因不明的慢性腹瀉、粘液便、粘液膿血便。
2、急慢性消化道出血的診斷和治療。
3、摘除結腸息肉。
4、腸套疊復位治療
5、X線鋇餐造影發現可疑病變。
6、取出異物。
7、結腸術後及炎症性腸病治療效果的觀察等。
2、禁忌症：
壞死性結腸炎、中毒性巨結腸、肛門病變伴有明顯疼痛者和全身性重症患者。
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