臨床上腰三橫突綜合徵被誤診為腰椎間盤突出症的並不少見。腰三橫突綜合徵在出現腰腿部疼痛、活動受限等方面時與腰突症狀相似。但是，腰三橫突綜合徵多為雙側第3腰椎橫突部有明顯壓痛點，疼痛沿大腿向下反射至膝平面以上，彎腰及旋轉時腰部疼痛加重，腰部活動受限尤以前屈、後伸明顯。並且可在腰三橫突頂端有固定壓痛並可能觸及到活動結節和條索狀物，或有肌纖鈣化後的剝離感，側臥屈髖試驗陽性，直腿抬高及加強試驗陰性。腰椎X線片可顯示第三腰椎橫突肥大。一般瘦長體型的人多發。
腰三橫突綜合徵的發病與其解剖學特點密切相關。第三腰椎位於腰椎生理性前凸頂點處，是腰椎活動的中心，因此兩側橫突所受牽拉應力最大，故在生長髮育時，其發育最長，橫突間有橫突韌帶，橫突末端有腹橫機、腰背筋膜、腰大肌和腰方肌等附著，當腰腹部肌肉強力收縮時，橫突末端韌帶、肌肉、筋膜、腹膜附著處承受拉力及槓桿作用力大，因此，末端組織損傷的機會最多。另外，腰部脊神經出椎間孔分為前後二支，前支較粗構成腰骶神經叢，後支較細，分為內側支和外側支，內側支分佈於肌肉，外側支為神經。這種解剖特點造成末端易受損傷，當腰部用力不均，引起第三腰椎橫突周圍組織急性損傷或反覆微小損傷，造成橫突、筋膜、韌帶附著處撕裂、出血、血腫和粘連、瘢痕，導致肌緊張和肌痙攣。長期反覆損傷導致L3橫突尖端周圍出現纖維化，形成瘢痕粘連、筋膜增厚和肌腱膜攣縮等一系列變化。
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