治療和預防膿毒性血栓最有效的方法是以膿毒症的發病機制為基礎進行治療和預防，但是遺憾的是目前膿毒性血栓的發病機制仍未完全闡明，在這種情況下，針對發病原因應做好臨床各方面的預防工作，努力降低誘發感染的危險因素對膿毒性血栓的治療和預防有著重要作用。
早期積極腸道營養、加強代謝與免疫調理、加強多器官功能保護與支援，是防治膿毒性血栓的重要手段。行早期胃腸道餵養可有效維護其腸道黏膜屏障功能，提供足夠的蛋白質和熱量，促進機體正氮平衡、降低高代謝反應，提高機體免疫力，預防和減少全身感染的發生。
監測尿量保證腎臟灌注、適當鹼化尿液、利尿等保護腎臟功能，對部分血肌酐、尿素氮極高且透析指徵明確儘早行血液濾過和腎臟替代治療，早期阻斷MOF的發生發展程序。
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