肛裂潰瘍引起的肛門疼痛常引起劇痛，癒合困難常由血熱腸燥，大便祕結，排便過於用力，使肛門面板破裂，反覆而發病。肛裂潰瘍引起的肛門疼痛常發於肛門後、前正中，以肛門後部居多，兩側的較少。初起僅在肛管面板上有一小裂口，有時可裂到皮下組織或直至括約肌淺層，裂口呈線形或稜形，如將肛門張開，裂口的創面即成圓形或橢圓形。
根據臨床表現，肛裂潰瘍引起的肛門疼痛應與其他疾病相鑑別。
1、肛裂三聯症：一般是指肛裂日久所導致的肛乳頭瘤或肛乳頭炎、哨兵痔、陳舊性肛裂或者是其導致的皮下瘻管三者，此三者在肛裂中，應屬Ⅲ期肛裂範疇。因此，肛裂三聯症是Ⅲ期肛裂。裂口呈陳舊性潰瘍，合併肛乳頭肥大及哨兵痔，或伴有皮下瘻管及肛隱窩炎症等。
2、肛門劇痛：就是肛門處劇烈疼痛。這種情況一般發生在排便時，但也可能在非排便時發生。主要與以下幾種疾病有關：肛周膿腫、內痔嵌頓、肛裂、肛管直腸癌晚期還有肛門異物。
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