菌尿是指清潔外陰後在無菌技術下采集的中尿標本，如塗片每個高倍鏡視野均可見到細菌，或者培養菌落計數超過100000每毫升。通常情況下，尿液是無菌的，但是尿道口周圍及尿道的下1/3是有菌的。因此，從人體排出的尿液可以沾染上一部分細菌。專家指出，菌尿是對人體傷害非常大的一種症狀，患者在治療菌尿前需要進行全方位的檢查，這樣才能及時確診該症。
常用檢查方法：
1、尿沉渣塗片找細菌：可以初步確定尿路感染是陽性球菌還是陰性桿菌感染，作為使用抗菌藥物的參考。清晨第1次新鮮中段尿沉渣塗片，每高倍鏡視野下細菌數<10個或無細菌，則通常中段尿培養陰性或菌落計數<103/mL;細菌數達15～20個則中段尿培養菌落數>105/mL。
2、尿液細菌培養：目前應用中段尿培養菌落計數的方法可以鑑別是否系尿路感染。<104/mL認為無意義或汙染，菌落數>105/mL可作為尿路感染診斷的根據，當菌落數104～105/mL為可疑。尿培養的常見微生物有致病菌、少見的不肯定的致病菌和汙染菌三大類。
3、結核菌檢查：為確定有無泌尿繫結核的重要方法。尿液濃縮塗片抗酸染色找結核菌，104～105/mL為陽性，但陽性率低。
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