肛門區腫脹疼痛是肛管直腸周圍膿腫的主要症狀。檢查時可見肛門區域性紅腫，壓痛及痛性硬塊。如何檢查肛門區腫脹疼痛呢？
本病的一般表現是，患者先感肛門處墜脹痛或刺痛，可捫及一硬塊，壓痛，繼之疼痛加重，痛性腫塊增大，並可出現畏寒、發熱。在3～5天后區域性可形成膿腫。低位膿腫區域性症狀重而全身症狀輕;高位膿腫全身症狀重而區域性症狀輕。膿腫可自行向肛管直腸內破潰自發排出膿液，排膿後疼痛緩解，全身症狀好轉或消失。形成肛瘻以後膿腫可反覆發作。
肛周皮下膿腫佔肛管直腸周圍膿腫的40%～45%，位於肛門、肛管下部的皮下組織內，上方由筋膜與坐骨直腸間隙分隔。多發生於肛門後側方。肛門區腫脹疼痛是本病的主要症狀。檢查時可見區域性紅腫，壓痛及痛性硬塊，化膿後有波動感，自行穿破者可見破口及膿液。本病診斷較易，如疑有膿腫形成，作穿刺即可證實。
坐骨直腸窩膿腫佔肛周膿腫的15%～25%，位於坐骨直腸窩內。坐骨直腸間隙呈楔形，在肛提肌與坐骨之間，底向下是肛門和坐骨結節之間的面板，尖向上在閉孔內肌筋膜與肛提肌的膜連線處。炎症初起時常覺肛門部不適或微痛，繼之出現全身症狀，如頭痛、體溫升高、脈搏加快、畏寒等，同時區域性疼痛加重，坐臥不安，排便時疼痛尤重。有排尿困難，裡急後重。查體時可見肛門旁腫脹，面板紫紅變硬，指診可捫及坐骨直腸窩飽滿隆起、觸痛。早期作坐骨直腸窩穿刺是發現膿腫的最簡單有效辦法。
骨盆直腸間隙膿腫約佔肛周膿腫的2.5%～9%，骨盆直腸間隙位於盆腔內，下為肛提肌，上為盆腔腹膜，後有直腸和側韌帶。前方男為膀胱和前列腺，女為子宮和闊韌帶。膿腫發生後主要表現為全身中毒症狀，肛門區域性表現不明顯，指診在肛提肌上方可摸到腫脹和觸痛。由於感染位置較深，早期診斷不易，故對全身性感染中毒症狀，乃至感染性休克而找不到病灶者要考慮本病可能，B超或CT檢查可幫助診斷。
馬蹄形膿腫是在肛門、肛管後方及兩側蔓延的膿腫，多數在後方，由後中肛腺感染所致或一側膿腫向對側蔓延所致，可分為高位馬蹄形膿腫和低位馬蹄形膿腫。臨床表現除全身感染症狀外，區域性表現為肛管後方腫脹及觸痛，後期破潰流膿。
肛周持續性劇痛、受壓或咳嗽時加重；可有全身乏力、發熱等感染表現。肛旁面板有明顯紅斑，伴硬結和觸痛，可以波動感,為肛周膿腫;直腸指診，患側有壓痛性腫塊為坐骨直腸窩膿腫;直腸上部的前側壁外有壓痛、隆起為骨盆直腸膿腫;直腸指診在直腸後壁有壓痛、隆起和波動感，為直腸後壁膿腫。高位肌間膿腫，肛周外觀無特殊，直腸指診在肛管上端或下端捫及表面光滑、卵圓形、邊緣整齊、質硬、壓痛的腫塊，或有波動者為高位肌間膿腫。肛門鏡檢有時可看到開口，若在周圍加壓，還可見到膿液自開口流出。
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