臨床中我們常見症狀有：眼球內斜、複視、面癱、吞嚥發嗆、步態不穩、頭痛頭暈。
一個或多個腦神經麻痺常為腦幹腫瘤的重要特徵，首發症狀為腦神經麻痺者佔24%。最常見的腦神經損害為展神經，其次為面神經和舌咽、迷走神經，症狀可表現為眼球內斜及複視，面癱，吞嚥發嗆，上瞼下垂、瞳孔擴大，光反射消失等。
如果學齡兒童出現眼球內斜，周圍性面癱，言語不清，吞嚥發嗆，步態不穩，應想到此病的可能，當檢查有一側腦神經麻痺和對側錐體束徵者，基本可明確腦幹腫瘤的判斷，需行進一步神經影像學的檢查。
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