腦膠質瘤的手術風險無外乎有兩方面，一方面是生命危險，另一方面是功能障礙，生命危險主要來源於一個是腫瘤術後出血，導致患者昏迷，最後可能導致死亡，另外，大面積的嚴重的腦梗塞也會導致生命危險，嚴重的感染，心臟，肺等其他重要臟器的嚴重併發症，都可以危及生命。
另一方面是功能障礙，我們的腦組織是神經中樞，負責支配身體的各種生理活動，腦組織的不同區域有不同的功能，包括語言、運動，感覺，視力等等，當負責某一功能的腦區或其附近長了膠質瘤以後，對這些功能區造成壓迫或侵犯破壞，那就可能導致相應的功能障礙，有時候手術前可能比較輕微，手術後會有相應的功能障礙的加重，最常見的功能障礙主要包括運動功能障礙、語言功能障礙、視力視野障礙和癲癇，另外還有精神，智力，記憶力障礙等等，有些是可逆的，術後可以慢慢恢復的，有些是不可逆的。
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