多囊卵巢綜合徵是一種多基因相關疾病，表現為一種複雜的遺傳方式，目前難以根治。
由於PCOS患者不同的年齡和治療需求，臨床表現的高度異質性，因此臨床處理根據患者的主訴、治療需求、代謝改變，採取個體化的對症治療措施，已達到緩解臨床症狀、滿足生育需求、維護健康和提高生活質量的目的。多囊卵巢綜合徵主要的治療原則是調整月經週期、儘量預防遠期併發症的發生發展。
多囊卵巢綜合徵患者無論是否有生育要求，首先均應進行生活方式調整，主要為控制飲食、運動和戒菸、戒酒。肥胖患者通過低熱量飲食和耗能鍛鍊，降低全身體重的5％或更多，就可能改變或減輕月經紊亂、多毛、痤瘡等症狀並有利於不孕的治療。減輕體重至正常範圍可以改善胰島素抵抗，阻止多囊卵巢綜合徵長期發展的不良後果，如糖尿病、高血壓、高血脂和心血管疾病等代謝綜合徵。在控制體重和調整生活方式的基礎上，改善胰島素抵抗，糾正高雄激素血癥和血脂異常等代謝異常，正確有效的調整月經週期，規範化處理子宮內膜增生，是預防多囊卵巢綜合徵遠期併發症的關鍵策略。
經過調整月經週期、肥胖及胰島素抵抗的治療之後，有部分患者能恢復排卵或成功受孕，但很多患者仍不能自發排卵，還需要進行促排卵治療，近年來對於有生育要求同時合併其他體外受精指徵的多囊卵巢綜合徵患者，體外受精-胚胎移植也是有效治療方案之一。
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