根據解剖部位，人們把泌尿系統分為上尿路和下尿路兩個組成部分。上尿路是指腎臟和輸尿管，發生在腎臟和輸尿管的結石就稱為上尿路結石。絕大多數上尿路結石是在腎臟內形成的，形成後或停留在腎臟內或下降到輸尿管而成為輸尿管結石。在輸尿管內形成的結石只佔極小部分。隨著人民群眾生活水平的不斷提高，上尿路結石已經成為尿石症的主要組成部分。
下尿路是指膀胱和尿道，發生在膀胱和尿道的結石就稱為下尿路結石。絕大多數下尿路結石是在膀胱內形成的，形成後或停留在膀胱內或排到尿道而成為尿道結石。只有一小部分下尿路結石是在尿道內形成的。還有一些下尿路結石是從上尿路形成後排到下尿路的。
過去，下尿路結石是尿石症的主要組成部分，常見於營養不良的兒童，現在這種情況已經很罕見了。現在，下尿路結石一般多見於尿道狹窄患者和前列腺增生症的老年男性患者。
我們通常根據結石所在的位置來命名結石的。如結石位於腎臟即為腎結石，位於輸尿管即為輸尿管結石。同一枚結石隨著位置的遷移，名稱也會作相應的改變。如一枚腎結石下移到了輸尿管，就叫做輸尿管結行：當它移到膨胱時，就叫做膀胱結行。
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