孕酮值隨著月經週期變化而波動，卵泡期孕酮水平在極低狀態，排卵後卵巢黃體產生大量孕酮，使水平迅速上升，在中期促黃體激素高峰後的第6~8天血濃度達到高峰，月經前又逐漸下降到卵泡期水平。激素六項檢查孕酮低原因是：
1、黃體期孕酮水平低於正常值，提示黃體功能不足。
2、懷孕初期孕酮水平較低，考慮有先兆流產或是宮外孕的可能。
3、妊娠期孕酮小於15.6nmol/L，提示可能出現胚胎停育。
4、在原發性或是繼發性閉經、功能失調性子宮出血、多囊卵巢綜合徵、口服避孕藥或是初期使用GnRH激動劑等，都可能出現孕酮水平下降。
檢查孕酮水平較低後，可以根據情況再複查。腎上腺、甲狀腺功能嚴重失調，也會產生一定的病理性身體，影響卵巢功能，導致受孕阻礙和影響，使排卵發生障礙，孕酮含量也會相應降低。非孕期和孕期處理是不同的，所以具體情況需要結合自身其他症狀綜合處理。
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