HPV檢測方法包括傳統的檢測方法和分子生物學檢測方法。
日常有性行為的女性感染HPV十分常見，多數感染是亞臨床和隱匿性的，其病變也是自限性和可逆的，只有部分發展為持續感染，其中一些可進展到宮頸鱗狀上皮病變。因此HPV檢測對發現、診斷和監測宮頸病變有重要的臨床意義。
HPV傳統的檢測方法包括細胞病理學檢測、陰道鏡檢測、組織病理學檢測、電鏡技術、宮頸攝像檢查和宮頸熒光檢查等。傳統的檢測方法存在靈敏度低、特異性差、假陰性率和假陽性率高、只能提示病變存在而不能對HPV進行分型等缺點。
目前HPV的實驗診斷技術主要是應用分子生物學技術進行HPVDNA的檢測，臨床上常用的HPV檢測方法有Southern雜交法、原位雜交法、PCR、斑點雜交法以及近幾年發展起來的雜交捕獲法。以分子雜交為基礎的商業試劑盒可以容易地在宮頸細胞塗片收集的標本中檢測HPV，而使HPV檢測得以臨床應用。目前應用較多的是經各種改進的PCR方法和雜交捕獲方法，可以檢查出HPV的準確分型。
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