一部分人在飲用牛奶後出現腹瀉症狀，這種叫做乳糖不耐受症狀。
牛奶中的主要碳水化合物是乳糖，在飲用牛奶之後，乳糖需要在小腸內乳糖酶的分解下吸收，而一部分人先天性的缺乏乳糖酶，導致乳糖不能被分解吸收，其中的乳糖隨後進入大腸，使得大腸內的水分不能夠被人體全部吸收。
乳糖不耐症的患者在飲用一定量的牛奶或是食用其他含有乳糖的食物後，一般在半小時到數小時之間產生會產生類似使用瀉藥後的腹瀉症狀，多為水樣大便，症狀的嚴重程度和食用的乳糖量有關，嚴重的還會有噁心、腹部脹痛，甚至上吐下瀉。對於哺乳期的嬰幼兒還會有尿布疹、生長髮育遲緩等。
所以確定有乳糖不耐症的，應當避免過量食用牛奶或是含有乳糖的奶製品，對於必須哺乳或是服用奶製品的嬰幼兒，可以少量多次攝入，並且限制攝入乳糖的總量。
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