婦科支原體感染易導致感染女性患上子宮內膜炎、陰道炎和盆腔炎等婦科疾病，需積極治療。
女性有支原體感染需加以重視，否則易對生殖系統健康造成影響，目前運用較廣的支原體感染治療辦法為西藥治療，可用的藥物有三大類，其中大環內酯類是首選藥物，莫西沙星等氟喹諾酮類藥物也有一定效果，可在做病原學檢查確定支原體型別後，再根據醫生指導服藥。
同時，女性因感染部位的構造較為特殊，還需輔助以一定的外用抗菌藥物，比如陰道栓劑等，能直接地殺滅陰道部位的衣原體。
此外，飲食控制對於支原體感染的治療也很重要，患者宜吃清淡且蛋白質豐富的食物，可增強自身免疫力，抵抗支原體，還可同時利用中藥進行調節，並加強外陰的衛生護理，最好是夫妻共同治療，以免治癒後因夫妻生活而再次感染。
婦科支原體感染治療以口服藥物為主，並輔助以外用抗菌藥，同時飲食合理和保持私處清潔衛生也有一定幫助。
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