多囊卵巢綜合徵是一種發病多因性，臨床表現多型性的綜合徵。個體臨床表現差異比較大，治療更要依據患者的情況、訴求予以針對性的治療。
對於肥胖者，加強鍛鍊，限制高糖、高脂肪飲食來減輕體重，會減少胰島素抵抗現象，減少雄激素水平，從而可能恢復排卵，減少糖尿病的發生；對於月經紊亂、無生育要求的患者，可以口服短效避孕藥進行週期療法，這是一種相對簡單和安全的方法，口服避孕藥可使卵巢和腎上腺產生的雄激素濃度降低，可抑制毛髮生長和治療痤瘡；對於有生育要求患有不孕症的患者，可促排卵治療，要小心誘發排卵時併發卵巢過度刺激綜合徵。另外還有手術治療的方法，在腹腔鏡下對多囊卵巢穿刺打孔，或者行雙側卵巢楔形切除，來降低雄激素，促進排卵，現已較少採用。
鑑於多囊卵巢綜合徵是一種複雜的內分泌系統的疾病，治療要根據不同患者的具體情況，雖然治療存在不小的難度，無法完全治癒，但是可以很大程度的改善症狀。
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