好發於男女生殖器及肛周，男性以冠狀溝及包皮繫帶周圍最為常見，也可見於陰莖、包皮、龜頭及尿道口等部位。
患者大多為處於性活躍期的中青年。發病前多有不潔性接觸史或配偶有感染史。潛伏期1～8個月不等，平均3個月。臨床上偶可見兒童發病，一般系通過接觸汙染的用具如毛巾等而傳染。
一、典型損害 初發損害為小而柔軟的淡紅色丘疹，針帽或米粒大，逐漸增大，且數量逐漸增多，成為乳頭瘤樣、菜花樣、雞冠樣或蕈樣的贅生物，表面高低不平，質地柔軟。如不及時治療，疣體將逐漸增大，有的成為大的菜花狀，基底有蒂;有的彼此融合，成為大塊狀，淡灰色，表面呈乳頭瘤狀，可以有糜爛、潰瘍、有分泌物，因繼發感染可致惡臭。患者一般無自覺症狀。
二、幾個特殊部位的尖銳溼疣
(一)男性尿道口 尿道口的疣狀贅生物，表面可以是光滑的也可呈乳頭瘤樣，顏色潮紅，表面溼潤。檢查時需將尿道口的黏膜充分暴露，方能見到疣體。有時HPV病毒可沿尿道逆行向上，造成尿道上皮的感染，此時需作尿道鏡檢查。尿道口雖不是尖銳溼疣的好發部位，但治療困難，且容易復發。
(二)女性宮頸 宮頸口上皮是從陰道復層鱗狀上皮向宮頸管柱狀上皮相移行的部分，雖不是尖銳溼疣的好發部位，但一旦為HPV16、18型所感染，上皮細胞多易發生非典型增生，乃至發生侵襲性癌。宮頸上皮感染多見亞臨床感染，以3％～5％醋酸溶液浸溼的紗布敷在區域性，以陰道鏡檢查損害更為清晰易見。
(三)肛門周圍 肛周面板多皺褶，且行走時多摩擦，因此一旦發生尖銳溼疣常常多發。初起時為多數丘疹，以後疣呈贅狀生長，可呈大的有蒂菜花狀，更多見扁平、表面有小乳頭的斑塊狀。由於繼發感染，分泌物常有難聞的臭味。個別病例病變可出現在肛門的黏膜上皮。發生在肛周的，應注意詢問有否同性戀，肛交史。
(四)口脣及咽部黏膜 偶可發生在口腔及咽喉部黏膜上皮，表現為小的、潮紅、柔軟、表面呈乳頭狀的疣狀贅生物。可發生在口交者。
三、巨大型尖銳溼疣 是指形狀巨大的尖銳溼疣，可以拳頭大小，表面呈乳頭瘤狀，因繼發感染，分泌物常有難聞的臭味。好發於男性的包皮黏膜面及龜頭，偶也可見於肛周及女性陰道。巨大型尖銳溼疣實質是一個疣狀癌。病理為低度鱗狀細胞癌的改變。雖然它極少發生轉移，但損害可向深部穿透。在男性可侵及尿道，產生許多竇道，從中排出膿液及尿。
四、亞臨床感染 是指上皮細胞已經受到HPV感染，但尚無出現肉眼可見的變化。亞臨床感染可以通過醋白試驗清晰地顯示出來。
五、HPV病毒攜帶者 採用敏感的分子生學技術即聚合酶鏈反應(PCR)，從尖銳溼疣患者的配偶或性伴侶的外陰部或陰道拭子標本中提取的DNA作模板，進行擴增，發現有相當比例的配偶或性伴侶HPV檢出陽性。他(她)們臨床上既無尖銳溼疣的損害，也無亞臨床的感染，可以說是HPV攜帶者。
六、冰山現象 泌尿生殖器部位上皮感染HPV後，可表現出一個相當寬的譜狀表現。從毫無臨床及顯微鏡下改變的HPV攜帶者;到出現顯微鏡下改變，但無內眼可見改變的亞臨床感染;到出現肉眼可見典型臨床改變的尖銳溼疣損害。事實上，在臨床上出現典型尖銳溼疣表現只是受染HPV人群中的一小部分，絕大多數處於HPV攜帶者或亞臨床感染的狀態。有的學者將其稱之為冰山現象，即臨床上出現典型尖銳溼疣表現的人數就如同浮動在大洋中冰山露出水面的那一小部分，而巨大的冰山主體即HPV攜帶者及亞臨床感染者則還隱藏在水面之下。
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