簡單地說是因為細菌感染後化膿引起的。肛周發生感染的原因主要有以下三個方面：
1、肛門腺感染：肛門腺開口於肛管直腸交界處的肛竇內，肛竇呈漏斗狀向上開口，易受損傷及細菌的侵入而引發感染。肛竇一旦感染後，會引起肛門腺感染化膿，炎症向肛周的間隙內擴散。因為肛周間隙抵禦感染的能力差，感染易於在這些間隙中擴散。
2、全身抵抗力下降：如糖尿病、年老體弱、過度疲勞以及結核患者的抵抗力下降，容易發生肛周膿腫。
3、肛門區域性刺激和損傷：如經常吃辣椒、喝酒等刺激性食物會導致肛管直腸區域性充血，區域性抵抗力降低而易發感染。另外，乾硬的糞便擦傷肛管面板粘膜，腹瀉患者的稀糞落在肛竇內導致肛門腺管阻塞，以及肛門直腸外傷或被隨食物吞嚥下的雞、鴨、魚骨刺傷肛管直腸等，均可導致肛門直腸周圍發生感染而形成肛周膿腫。
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