帕金森患者早期起病大多數為單側肢體，如一側肢體的震顫或僵硬。但隨著病程進展，最後基本都為雙側受累，即使一側症狀明顯，另一側症狀輕微。當前，選擇手術的患者大部分為病程較長，藥物效果下降，這樣的患者，病史一般都在5年以上，症狀基本為雙側，所以，大部分患者選擇雙側治療。病史超過5年的患者，即使症狀輕微的一側對患者日常生活影響不大，醫生也建議患者做雙側腦起搏器治療，因為，症狀是不斷進展的，也就是說，帕金森病的症狀會逐漸加重，病情會不斷髮展，最終，均為雙側受累。我們臨床工作中，也經常遇到早期行單側手術，3-5年後，因為症狀進展，又來做另一側，這樣的病人並不少見。
從費用上看，當前，均為可充電腦起搏器，為一拖二結構，也就是說，一個電池，帶兩根電極，大部分費用在電池身上，做雙側腦深部電刺激，並不會增加明顯費用。相反，做一側，幾年後再做另一側，不僅會增加手術次數，患者受兩次痛苦，費用也會明顯增加，手術方式也會有一些改變。
從程控上看，國外有學者報道，1+1大於2的結果，也就是說雙側同時刺激大於單側刺激。雙側刺激對帕金森病的非運動症狀也有一定的效果。
對於其它疾病，如特發性震顫，僅侷限於一側上肢，可以考慮單側手術，對全身性肌張力障礙、抽動症、抑鬱症、強迫症，建議雙側腦起搏器手術。
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