腸炎的治療要根據病因進行治療，部分腸炎用諾氟沙星無效，感染性腸炎可用諾氟沙星，一般服用1-2周。
腸炎種類較多，根據病因可分為感染性腸炎、潰瘍性結腸炎、結核性腸炎等，潰瘍性腸炎及結核性腸炎需針對病因進行治療，服用諾氟沙星無效，如果同時合併細菌性感染，也可以服用；諾氟沙星一般用於感染性腸炎患者，敏感菌感染患者可1-2周治癒，如果細菌出現耐藥或治療效果不佳，可能需聯合其他藥物治療，同時進行輸液、止痛、止痙等對症治療。
腸炎患者在日常生活中應注意飲食，建議清淡飲食，儘量避免辛辣、生冷等刺激性食物，多進食蔬菜、水果。
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