1、流感樣症候群：患者發熱、寒戰、全身不適，肌痛、頭痛等，有時還可出現鼻塞、流涕、頭暈、尿急等，而以發熱最為常見。不論應用途徑及劑量大小，患者均可有發熱，一般在第一次注射後2-6小時發生，體溫可升至38-40℃。若發熱不高，可不必特殊處理，或多喝開水，臥床休息，但若發熱較高甚或高燒者，則應給予物理降溫，亦可給布洛芬0.2克口服，消炎痛栓0.5-1枚直腸給藥，體溫便會很快下降。
2、一過性骨髓抑制：抑制骨髓，降低外周血白細胞及血小板，白細胞減少通常發生於用藥後數小時至數日。用藥第一週，白細胞減少至40％-60％，而後趨於穩定。(如果中性粒細胞絕對計數≤1.0×109/L、血小板<50< span="">×109/L，應該減少劑量，1至2周後複查如血細胞恢復，藥物劑量也可復原;如中性粒細胞≤0.75×109 /L，血小板≤30×109 /L，應該停藥)。主要是干擾素能可逆性地阻斷白細胞、血小板從骨髓釋放的緣故。通常可服利血生、鯊肝醇及氨肽家等藥以升高白細胞及血小板。
3、消化系統反應：如食慾不振、味覺異常、噁心、嘔吐、洩瀉、腹脹等。藥量越大，症狀越頻繁，但一般不需治療，較重者可對症處理。嚴重者應考慮減量或停藥。
4、面板反應：用藥超過4個月者的最常見副作用是輕、中度脫髮，偶有停藥後更嚴重者。斑丘疹多發生於軀幹和四肢，但多為暫時性的;還有發生潛在特異性反應，表現為瀰漫性紅斑及蕁麻疹等。
輕度皮疹多呈自限性，不必處理;嚴重者應考慮停藥或減量，並給抗過敏治療。
5、腎臟損害：最常見者為輕度蛋白尿，少有>0.1克/日，亦不伴有血漿蛋白的減少。其他腎臟損害雖有報道但極少見。通常無需特殊處理，囑患者多喝開水即可。
6、精神異常：表現為抑鬱，妄想、焦慮等精神病症狀。如干擾素導致如此症狀，則需要密切關注，必要時停止干擾素治療。如果有抑鬱情緒或精神病史的患者應儘量避免使用干擾素抗病毒。
7、對內分泌系統的影響：11-羥皮質類固醇增加，雌激素水平下降，高密度脂蛋白降低，出現糖尿、血糖升高，偶見高血鉀、低血鈣等症，還能提高血漿甘油三酯含量。
8、干擾素誘導產生自身抗體和自身免疫性疾病：包括甲狀腺抗體、抗核抗體和抗胰島素抗體。多數情況下無明顯臨床症狀，部分患者可出現甲狀腺功能低下或者亢進、糖尿病、銀屑病、白斑、類風溼關節炎、系統性紅斑狼瘡樣綜合症等，嚴重者要停藥。
9、抗干擾素抗體的產生：部分患者治療初期甚至未應用干擾素時即出現抗干擾素抗體，影響治療效果。估計與個體差異有關，而與應用劑量、給藥途徑、時間長短及患者年齡無明顯關係。
注意：干擾素的副作用的處理應該在醫生指導下，必要時用藥物糾正，嚴重時，應該減量或停藥，待恢復後再使用，如果副作用嚴重，並無法糾正，應考慮改用其它抗病毒藥物。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。